Турция стала первым государством, признавшим независимость Кыргызстана. Независимость Кыргызской Республики была объявлена 31 августа 1991 года после принятия «Декларации о государственной независимости».
29 января 1992 года были установлены дипломатические отношения между двумя странами. В том же году были открыты посольства в Бишкеке и Анкаре.
С созданием механизма Совета стратегического сотрудничества высокого уровня (ССВУ) 26 апреля 2011 года отношения между Турцией и Кыргызстаном вышли на уровень стратегического партнерства.
В ходе официального визита президента Реджепа Тайипа Эрдогана в Кыргызстан 5 ноября 2024 года была подписана совместная декларация, предусматривающая выведение партнерских отношений, установленных в 2011 году, на уровень всеобъемлющего стратегического партнерства. Договор о вечной дружбе и сотрудничестве между Кыргызской Республикой и Турецкой Республикой был подписан 24 октября 1997 года. Декларация «Турция и Кыргызстан: вместе в XXI век» была принята в 1999 году. Это основополагающие документы сегодняшнего стратегического партнерства между двумя странами.
Президенты двух стран совершают взаимные визиты, а также проводят встречи в рамках саммитов Организации тюркоязычных государств (ОТГ), сессий Генеральной Ассамблеи ООН, заседаний Организации исламского сотрудничества (ОИС), церемоний открытия Всемирных игр кочевников и других международных мероприятий.
Между Турцией и Кыргызстаном подписано более 100 соглашений о сотрудничестве в различных областях, включая образование, здравоохранение, культуру, торгово-экономическое сотрудничество, транспорт, связь, военную, техническую и оборонную сферы.
Соглашение о сотрудничестве в области образования, науки и культуры между Республикой Кыргызстан и Турецкой Республикой, подписанное в Бишкеке 3 марта 1992 года, стало первым документом в истории кыргызско-турецких отношений в сфере образования.
Турция является одной из стран, которая оказывает Кыргызстану наибольшую помощь в социальной сфере и поддерживает проекты развития.
Турецкое агентство по сотрудничеству и координации (TİKA)
Реализовало в стране более 1000 проектов с 1993 года.
Самым важным из этих проектов является Бишкекская государственная больница кыргызско-турецкой дружбы имени Реджепа Тайипа Эрдогана. Она начала приём пациентов в 2021 году. Больница рассчитана на 72 койки, из которых 21 – реанимационная.
Больница, общая площадь которой составляет 12 тысяч квадратных метров, оснащена самым современным оборудованием.
В настоящее время в ККыргызстане функционируют более 300 предприятий с турецким капиталом, на которых работают более 10 тысяч человек. По оценкам, турецкие инвестиции в экономику Кыргызстана превысили 1 млрд долларов.
В Турции осуществляют 111 компаний с кыргызским капиталом.