Железная дорога Агдам-Ханкенди была построена в 1979 году.
Благодаря открытию железной дороги Баку-Евлах-Ханкенди ускорилось социально-экономическое, культурное развитие Карабаха, укрепились его связи с Баку.
Помимо улучшения материально-технического снабжения населения, это позволило также значительно повысить экономические показатели региона. Так, из-за снижения затрат на поставку сырья и перевозку продукции существенно снизилась себестоимость продукции, производимой в Карабахе.
В 80-х годах прошлого века годовой оборот грузоперевозок на участке железнодорожной линии Барда-Агдам линии Евлах-Ханкенди составлял 1,5 млн тонн, а на участке железнодорожной линии Агдам-Ханкенди (27 километров) – 1 млн тонн. В тот период скорость поездов составляла 60 км/ч на железнодорожной линии Барда-Агдам, 40 км/ч – на железнодорожной линии Агдам-Ханкенди.
В результате оккупации Арменией 20 процентов территории Азербайджана в начале 1990-х годов железнодорожному хозяйству республики, как и другим отраслям экономики, был нанесен значительный ущерб. Вместе с техникой была оккупирована важная часть железных дорог Азербайджана, остановлена деятельность железной дороги Евлах-Ханкенди, захвачены станции Агдам, Аскеран и Ханкенди этой линии, железнодорожные пути были зверски уничтожены армянами.
Спустя тридцать лет на освобожденных землях Азербайджана возрождается жизнь – реализуется строительство новых железнодорожных линий в этих регионах.
Распоряжением президента Азербайджана от 24 ноября 2020 года начато проектирование и строительство железнодорожной линии Барда-Агдам. В настоящее время выполнено 90 процентов проектных работ, физический прогресс по строительно-монтажным работам линии составляет 70 процентов. Проложены длинномерные рельсы протяженностью 56,951 км, а также полностью завершены первый этап земляных работ, строительство инженерных сооружений, укладка элементов верхнего строения пути и стрелочных переводов. До конца текущего года планируется завершить работы по проектированию и строительству железнодорожной линии Барда-Агдам.