Ученые нашли способ автоматизировать управление микроскопом для автоматической фиксации событий. Статья об этом опубликована в Nature Methods.
Чтобы пронаблюдать деление единичной бактерии, зачастую за ней надо следить несколько часов. Человеческое внимание ограничено, и потому использование микроскопа для наблюдения за динамическими процессами довольно трудоемко.
Ученые из Федеральной политехнической школы Лозанны придумали сделать систему для наблюдения за делением клеток на основе искусственного интеллекта. «Умный микроскоп похож на беспилотный автомобиль. Ему необходимо обрабатывать определенные типы информации, видеть тонкие закономерности, на которые он затем реагирует, изменяя свое поведение. Используя нейронную сеть, мы можем обнаруживать гораздо более неуловимые события и ускорять сбор данных», — комментируют разработку авторы.
Нейросеть обучена фиксировать митохондриальные сужения, предшествующие делению клеток. В случае обнаружения такого события микроскоп автоматически переходит в режим высокоскоростной фиксации и стремится сделать как можно больше кадров, что бы ученые могли наблюдать процесс в замедленной съемке. У этого алгоритма исходный код, и потому его могут использовать любые исследователи и модифицировать под себя.
Ученые надеются, что их разработка позволит ускорить биологические наблюдения и собрать большую базу данных о делении клеток.