İngiliz bilim adamları, nazofarenksten alınan örneklerde Coronavirus SARS-COV-2’nin kökeninin çeşitli seçeneklerini veya hatlarını tespit etmek için allele özgü bir prob polimeraz zinciri reaksiyonu geliştirdiler.
Yeni kantitatif polimeraz zincir reaksiyonunun (PCR) yönteminin, tahrip edici bir viral RNA’lı numunelerde bile virüs sürümlerini gerçek zamanlı olarak tespit etmenize izin verilir. Viral varyantların tespiti için altın standardı, tam üretim sıralaması (NGS) yöntemleri olarak kabul edilir, ancak bu yöntemler için numuneler iyi kalitede ve yüksek seviyelerde viral RNA olmalıdır, ek olarak NGS yöntemleri pahalıdır ve kütle kullanımı için kullanılamaz. .
Bilim adamları, SARS-COV-2’sinde, İngiltere’de ve ayrıca Brezilya’dan 365 örnekte bulunan hastalarda alınan 717 numunedeki viral versiyonları tespit etmek için alerje özgü prob PCR adlı yeni bir yöntem kullandılar. / p>
Verilerine göre, ilk durumda, Virüs S-protein mutasyonunda D1118H, alfa seçeneğinin karakteristiğinde ve ikinci – K417T ve L3468V mutasyonlarında, Gama-Seçenek Coronavirus’un özelliği.
Her iki durumda da, ALL-spesifik prob PCR duyarlılığını NGS yöntemleriyle karşılaştırdığı bildirildi.
Sonuç, tespit edilen virüs seçeneklerinin karşılaştırılabilirliğinin yüzde 99’unda, çok çeşitli virüs yükleriyle numunelerdeki yeni yöntemin doğruluğunu yüzde 25 oranında daha yüksek olduğunu göstermiştir. Ayrıca, yok edilen RNA’lı numunelerin yüzde 95’ini etkili bir şekilde tanımlarken, NGS yöntemleri bozulmuş numunelerin yüzde 11’inden fazlası ile sıralanabilir.
Yeni yöntem, alfa varyantı için yüzde 98 duyarlılık ve yüzde 100 özgüllük gösterdi. Gamma varyantı için bu parametreler sırasıyla 90-95 ve yüzde 91-100’dür.
Geliştirilen yöntemin bir diğer avantajı, Gelecekte SARS-COV-2 genomunda ortaya çıkan yeni mutasyonları hedeflemek için bir ışık değişikliğidir; bu, yeni Coronavirus’un yeni suşlarının yayılmasının operasyonel takibi için çok önemlidir.